廷和外廷的争权，他叮嘱刘若愚道：
“宋献策提出的永生种虽有偏颇之处，却有利于军心。”
“一定不能让军人自认短生种，要让城隍司派随军祭司在军中宣扬，多宣传永生种的理论。”
“还可以和儒家的立德、立言、立功这三不朽结合，宣扬立功不朽。绝不能让短生种思想在军中流传，让军人自认蛮夷。”
“民间则主要宣传长生种思想，让士民看远一点，不要急功近利。”
“短生种、速生种则是末流，要斥为蛮夷、奴隶。”
心中担心永生种、长生种、短生种、速生种的宣传，有可能引起阶层分化，导致大明人被分门别类。
朱由检决定主要宣传长生种和永生种思想，对于在大明比较少的短生种、速生种，则要压低声音。
就算阶层要分化，他也希望大明人向永生种进化。而不是把一些人贬为短生种、速生种，作为受压迫阶级。
刘若愚随高时明编撰道经，对宗教事务还是比较了解的。他笑着道：
“仙道贵生，无量度人。”
“无论城隍司还是道教，都是适合长生种的宗教，而且注重今世。”
“唯有佛教，更关注轮回转世，而且僧人要出家剃度，不会留下后裔。”
“臣以为正神册封，要把佛教的一些神灵排除出去。”
这个说法，让朱由检颇是惊讶，不明白刘若愚为何对宗教这么关心。
其实这是他忽略了宗教对太监的影响，大明的太监因为无后，多以宗教为寄托。
宦官大部分信仰的是佛教，也有高时明那样信奉道教的人。
刘若愚作为高时明一派，当然更倾向道教，这是他为道教说好话、想压制佛教的原因。
朱由检对他的小心思不怎么在意，他从刘若愚对宗教的关心，想到了宦官的宗教信仰，这是必须要重视的问题。
还有就是宦官在长生种理论中，应该属于哪一类：
『宦官虽然多有高寿者，但是因为无后，行事多无顾忌，秉承的是短生种思维。』
『看来要对他们多加教化，而且要和皇子隔开。』
短生种思维，天然带着急功近利的特点，这是朱由检不愿看到的。
所以他决定在皇子的教育上，一定要排除宦官的影响，这些人不是正常人。
在教化方面，他打算鼓励宦官
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