江东认为：“从古未闻假南兵捍北敌者。南兵之北，譬舟之陆也。”
原兵部尚书，现任吏部尚书杨博也认为燕、赵之地，士马强悍，渔阳战卒，自古称雄，东南民素柔脆，莫任远戍，任用朱载坖调南兵北上是违背常识的，戚继光虽然在东南打的不错，但是那是对于倭寇而言的，在大明朝臣的心目中，倭寇的战斗力是远远不如北虏的。
再说了，北方作战，马军为上，而南兵素不习弓马，怎么能够在北方作战呢？况且朱载坖希望将戚继光部的六千人从浙直调往蓟镇，千里跋涉，所费的钱粮不菲，虽然戚继光是朱载坖的心腹爱将，杨博等人也不希望将南兵北调。
对于杨博等人的意见，朱载坖并没有采纳，一方面杨博本来就不了解戚继光等人，二就是杨博的这个建议是包含私心的。现在九边的总兵等将官，多出自山西及宣大两镇，山西将门的影响力是很大的，九边所称名将，多是山西人，而朱载坖现在准备从南方调兵来，显然就会触动山西将门的利益，所以杨博肯定是不愿意的。
但是朱载坖显然并没有将杨博等人的话听进去，朱载坖下诏，调原浙直总兵官戚继光及麾下浙兵六千与蓟镇，充任提督蓟辽等处军务事兼蓟镇总兵，原宣府镇总兵、丰州伯马芳升任提督宣大山西等处军务事，原蓟镇总兵官李成梁调任宣府镇总兵官。
同时对于东南的防务，也作了调整，戚继光调走后，原浙直总兵官撤销，刘显任浙江总兵，汤克宽任南直隶总兵，俞大猷调任广东总兵，以应对在两广、福建日益猖獗的海盗。
对于朝中的非议，朱载坖予以了坚决的回应，朱载坖下诏称：太祖定鼎应天，削平天下，所用者淮泗之兵也，何言南兵不堪也！
在朱载坖的强硬推动下，戚继光部得以北上。除此之外，对于整个大明的边防，朱载坖也开始按照自己的思路进行整顿了，之前徐阶已经派遣御史清军，核实士卒人数，减少军费的浪费了，朱载坖还有进一步的整顿军务。
戎政莫急于马政，马匹是现在战事最重要的物资，没有战马，官军始终在战事中出于劣势，保障官军的战马是现在的当务之急。朱载坖决心从两个方面着手，首先是保障现有的战马，大量朝廷的战马从
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