监察机关，直接受皇帝的指挥，对于专门的领域或者是事项进行监察，完全按照皇帝的旨意办事，同时负责文书审核甚至是封驳等事项，是皇帝在近侍机构中对于内阁进行制约的部门。
经过朱载坖改革之后的诸科，无专官，无专事，奉圣谕纠劾，是皇帝的耳目，同时也是对于翰林官员们进行选拔的一种途径。通过科道的监察，对于朝廷的各级衙门加强控制，防止出现贪墨等事项。
其三就是国务会议，这也是朱载坖想出的一个办法，在朱载坖对于内阁制度化了之后，看似内阁从品级上权压各部院，但是朱载坖还是为各部院流出了一条道路，就是国务会议，是由皇帝主持的对于朝廷重大事项予以讨论的会议，看起来类似于之前的廷议，但是实则完全不同。
国务会议最大的特点是权威性，在国务会议上所作出的决定，是要被当即御批明发实施的，这样就使得内阁的决策权力收到限制，平衡内阁和部院之间的权力。