理寺为主。
但是在实际的司法实践当中，大理寺很难有效的履行职务，太祖皇帝是很重视大理寺的，他曾经说过：“大理之卿，即古之廷尉，历代任斯职者，独汉称张释之、于定国，唐称戴胄。盖由其处心公正，议法平恕，狱以无冤，故流芳后世。今命尔为大理寺卿，当推情定法，毋为深文，务求明允，使刑必当罪。庶几可方古人，不负命也。”
但是大理寺既受到刑部和都察院的掣肘，又受到其他部院和内阁的压力，在这种情况之下，大理寺想要独立、公正的处理案件，显然是不可能的，这点朱载坖一直就很清楚，所谓大理寺的复核权，很多时候反倒成为了朝廷各派政治势力加以斗法的工具，所以朱载坖认为，首先应该加强大理寺的权力。
在和太子以及阁部重臣们商量之后，朱载坖认为应该将大理寺升格为正二品衙门，和刑部、都察院一致，当然升为正二品衙门的大理寺自然就不能叫大理寺了，而是改称大理院。