在这里设立自由通商港，并且也可驻扎武装部队。对于福建官府来说，起码海汉人对大明的态度一向还是非常“友善”的，对于福建这边抵抗十八芝的战争也一直是不遗余力地进行了支持，把这地方交给海汉，总比落在十八芝或者荷兰人手里放心多了。
话说回来，荷兰人目前在台湾岛上还有一处据点，尽管双方已经达成停战协议，但大员港的存在对福建海岸依然是一种威胁。而澎湖正好位于大员港和福建之间，海汉人在这里落脚之后，荷兰人肯定就不可能越过澎湖来对福建采取军事行动。从这个角度来说，海汉占据澎湖倒也相当于是把原来的保护伞撑得更大了一些。
5月2日一天下来，联军在澎湖岛上抓捕了二千八百余名俘虏，另外在战斗过程中打死打伤了四百多人。负责清理附近岛屿的福建水师也小有斩获，抓捕了三百多名俘虏。联军在此过程中只出现了少量的伤亡，其中阵亡的几人都是隶属于明军，海汉民团这边倒是很幸运地只有几名伤员。
而经过一整天的清点之后，联军在前一天攻打澎湖岛的作战中所取得的战果也初步统计出来了。联军舰队在昨天的两场海战中击沉击伤敌军船只六十余艘，俘虏了八十多艘。而由于相当一部分死于海战的十八芝人员已经随船一起沉入海中，具体的伤亡数字已经难以进行统计，但从击沉击伤的船只状况所做的粗略估计，十八芝在昨天的两场海战中至少丢掉了上千条性命。当然了，以这些人的牺牲来换取十八芝主力的脱逃，其实对十八芝而言还是划算的。要不是被这两支船队给拖住了行进速度，被堵在澎湖岛的恐怕就不是三四千人，而是要上万了。
尽管最终截杀的效果不是特别尽如人意，没有能完全达到战前计划的打击效果，但如果从战损比来看，联军这边的确已经占了大便宜，并且也着实对十八芝的实力造成了一定的打击。光是第一天的两场海战，就已经让十八芝丢掉了五成以上的武装战船。至少在短时间之内，十八芝恐怕是很难恢复到他们鼎盛时期的武力水平了。
5月3日，陆军继续在岛上执行清理搜捕的任务，而前一天派去追击十八芝的两支舰队也在这一天返航归来。他们在前一天的下午追
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