军官和战斗骨干，大部分印尼师团的士兵，都躲在很深的钢筋水泥结构的工事里，虽然部分印尼士兵都挺过了冲击波和光辐射，但是距离爆心较近的工事仍然没能保护兵员的性命。
被山本五十六撤往大分水岭的倭军主力，一部分撤到了大分水岭悉尼附近的蓝山，面对东面的大海构筑了坚固的永久性工事。虽然倭国军队的士兵们，已经传达了有关原子弹的消息，但是由于时间紧迫，倭军不可能对士兵进行更深入的宣传和训练。因此，在面向悉尼方向的工事内，倭国军队已经接到上面命令，一律隐蔽在工事内，不得私自向悉尼方向瞭望。倭兵根本想象不出原子弹有多么厉害，以为远离悉尼几十里的地方不可能有，会比大口径舰炮更具威胁的武器了。所以，免不了处于好奇心，从工事里探头探脑，希望知道悉尼一带发生什么，一部分倭国士兵因此被原子弹爆炸的强光致盲。
倭国澳洲驻屯军司令山本五十六，在地下坑道工事内感到了强烈地震动，随后便失去了同一线岸防部队所有联系。为了搞清悉尼方面的情况，山本五十六登上山顶用望远镜瞭望，眼前的情景令他大吃一惊。在巨大的蘑菇状烟云下面，整个地形地貌较原子弹爆炸前，已经变得面目全非，所有建筑和树木几乎被扫光，成了名副其实的一大片白地。苦心经营的岸防工事，已经被彻底摧毁，到处都是一片焦土，看不到半点生命的迹象。看到此情此景，山本五十六出了一身冷汗，如果不是事前做了充分的防备，至少十几万的兵力将会化为乌有，防御体系也将被轻松瓦解，美英联军的士兵将无任何阻碍地登陆澳洲。山本五十六立即返回地下指挥部，了解原子弹爆炸区域和附近部队的伤亡情况，以及防御设施和武器装备的损失情况，反馈的数字更令山本五十六惊心。留守在悉尼和布里斯班的印尼师团，在原子弹爆炸后已经十去七八，即使没有立即死亡的也受到严重的灼伤，或者受到大剂量的射线照射患了急性放射病，军医们从来没有见过这种怪病，一时间感到束手无策。距离爆心稍远的部队，也遭到了冲击波和光辐射的，不同程度的杀伤，因为坍塌和起火造成的继发杀伤较多，使大批的士兵失
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