他在崇祯癸酉年成为举人；在崇祯十三年庚辰，他以副榜的身份被任命为延安府推官。在任期间，他有效地招抚了混乱的局面。
他曾奉命追捕贼人李明才等三百人，并成功歼灭他们；他还招降了贼人张成儒、丁世蕃等三百余人，以及庆阳土贼潘自安等千余人，使得延安地区逐渐恢复平静。
此人还曾上书孙传庭，指出出关的安危关系到整个陕西，进而影响到整个天下。
他引用兵法中的“兵无选锋曰北”，暗示如果出征失败，后果将非常严重。
但那时的孙传庭和崇祯还未遇到顾横，他的建议也未被采纳。
当贼人攻陷西安时，顾咸正率领三百人登城防守，但最终因敌众我寡而弃甲投降。
贼人试图劝降他，但他宁死不屈，最终被囚禁。
后来吴三桂的军队进入陕西时，许多人响应；
韩城人推举顾咸正为主，斩杀了伪令王业昌。
但后来发现是清军，于是顾咸正逃入山中。
而在山中，他遇到了由新军精兵强将领导的北方义军游击队，从而加入义军，后来又正式加入新军。
而原来没有顾横和新军的时空中，顾咸正在第二年，剃发归顺南明。
那时又恰逢云间吴胜兆、陈子龙的事件败露，顾咸正的名字被列在党羽名单上，他与四十多名同事一同被处死。
顾咸正的儿子顾天逵，字大鸿，是贡生；顾天遴，字仲熊，是诸生。他们因为藏匿陈子龙而被处死。
当顾咸正被解往南京时，审官洪承畴问他是否知道史可法，顾咸正反问洪承畴是否知道他自己是否已经死了。洪承畴无言以对。
在清军经过的州县，官员大多投降，很少有殉城的。但顾咸正的弟弟顾咸建，字海石，号如心，是崇祯癸未年的进士，任钱塘知县。
因为焚烧册籍而被捕，他宁死不屈，最终被杀。
当时天气炎热，他的头颅挂在镇海楼三天，却没有苍蝇聚集。
杭州人将他收殓，并在土谷祠中祭祀他。
顾咸正的另一个弟弟顾咸受，是天启甲子年的举人；城破时，他也死了。家中仅存一个五岁的孙子顾晋谷，得以幸免。
顾咸正的家族成员都表示“世受国恩；虽书生，义不苟活”，因此一门父子、五人同死国事。吴中人士对他们的遭遇深感悲痛
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