国地方行政机构的关系，分为两个阶段。
在大远征时期，一切奉行先军主义和战时条例，很多刚被纳入帝国版图的行星的行星总督，就是由远征军大本营——也就是战帅荷鲁斯直接任命的，各个军团的基因原体也可以直接任命行星总督。
在41K时期，高领主议会严令禁止星际战士战团参与地方行政，除了战团自己的家园世界，除了奥特拉玛五百世界这种摄政王的直属领地，任何星际战士都不允许插手地方行政，包括行星守备军和帝国卫队。
这个小小的细节，标志着人类帝国从基因原体和星际战士的时代，进入到了凡人当家做主的时代。
而大清洗时期，就处在这样一个历史转折的关键节点，基因原体们都还没有因为各种原因消失，但是军政分离的主旨已经开始体现，星际战士们已经不再插手地方行政机构的运作了。傅青海虽然不能直接要求军务部和内政部怎么样怎么样，但是有察合台·可汗在，有伊利娅·拉瓦雷在，运作个行星总督和帝国卫队指挥官，还是绰绰有余的。
虽然什未林巢都是由傅青海一个人收复的，但是在明面上，这些人事任命和傅青海没有任何关系，并且大部分星际战士都专注于战斗任务，也不会想着去插手地方行政。
当然也有反面案例，后世承担大漩涡防御任务的星辰之爪战团，战团长鲁夫特·休伦，就是因为擅自截留什一税和帝国当局闹翻了。
休伦被泰拉政府的官僚主义逼疯了，想要按照自己的想法来布置大漩涡防区，干脆就成为了巴达布星区的实际控制者，人称“巴达布暴君”，审判庭当然不能坐视不理，于是“巴达布战争”开打，最终休伦失败逃进大漩涡，从此红海盗的黑心王，成为了仅次于阿巴顿的混沌势力领军人物。
有黑心王休伦的“前车之鉴”，哪怕现在还不是41K时代，神机兄弟会也不能和什未林巢都的地方行政扯上任何关系——明面上的关系。
傅青海又不是休伦那种脑子一根筋的憨货，非要公开抗税把矛盾激化，他大可以采用代理人的方式来掌控什未林巢都世界，行星总督格拉迪斯是他一手扶上去的，行星驻军的长官柯什维托也是他的人
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