与工匠们一起探讨如何提升火器性能。一日，他兴奋地进宫向朱由检汇报：“陛下，经过工匠们的努力，新研制的火炮威力大增，射程更远，精准度也有所提高。”
朱由检听后十分高兴：“好！孙爱卿，继续加大研发力度，尽快将新装备投入军队使用。同时，也要注意对新技术的保密，防止泄露。”
孙传庭说道：“陛下放心，臣已安排专人负责保密工作。”
然而，军制改革并非一帆风顺。一些守旧的将领对改革心存抵触，认为这会削弱他们的权力。他们暗中串联，企图阻止改革的推行。
洪承畴得知此事后，进宫向朱由检奏报：“陛下，部分将领对改革不满，暗中阻挠。长此以往，恐影响改革进程。”
朱由检神色冷峻：“这些人只顾一己私利，不顾国家大局。传朕旨意，若有胆敢继续阻挠改革者，革职查办！”
孙传庭气愤地说：“陛下，这些人实在可恶！臣愿带兵将他们制服，以正军法！”
朱由检摆摆手：“先礼后兵。杨爱卿，你去与这些将领沟通，晓之以理，动之以情，让他们明白改革的重要性。若仍执迷不悟，再按朕的旨意处置。”
杨嗣昌领命：“是，陛下。臣定会尽力劝说他们。”
杨嗣昌找到那些守旧将领，耐心地与他们交谈：“诸位将军，陛下推行军制改革，实是为了我大明军队的长远发展，为了保家卫国。改革虽会触动一些眼前利益，但从长远看，对大家、对军队、对国家都有好处。望诸位将军以大局为重，支持改革。”
一些将领听了杨嗣昌的话，有所触动，说道：“杨大人，我们明白了。只是担心改革后，自己的地位和权力受到影响。”
杨嗣昌说道：“诸位将军放心，改革并非针对个人，而是为了提升整个军队的战斗力。只要诸位将军积极支持改革，为军队做出贡献，陛下定会论功行赏。”
经过杨嗣昌的一番劝说，大部分将领表示愿意支持改革。但仍有少数将领冥顽不灵，坚持反对。
朱由检得知后，果断下令将这些将领革职查办，以儆效尤。此举震慑了军中其他有异议的人，军制改革得以继续顺利推进。
随着时间的推移，军事院校正式开学，第一批学员开始接受系统的军事训练和教
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