于今年要南巡，所以各种祭祀活动非常之隆重，朱载坖自己亲自祭祀太庙，同时带上太子祭祀社稷，遣英国公、成国公、定国公、武定侯、阳武侯、宁阳侯、安远侯、丰城侯分别祭祀成祖、仁宗、宣宗、英宗、宪宗、孝宗、武宗和世宗诸陵。
令魏国公徐鹏举、督师南京张居正、南京守备恭顺侯吴继爵祭祀孝陵，承天府官员祭祀显陵，先把所有的祖宗都拜了个遍，礼多人不怪嘛。
在此之后，朱载坖就南巡的具体时间和诸位重臣们开始商议起来，最开始重臣们建议端阳节之后出发，这个时间被朱载坖坚决拒绝了，因为往返南京就要两月，朱载坖还考虑到防秋的事情，朱载坖担心俺答今年会缓过来进犯大明，所以最好是早去早回。
经过朱载坖和重臣们的商议，再加上钦天监的测算，最终决定在隆庆三年三月十六日出发，朱载坖随即下诏，将南巡的事情正式昭告天下，同时由于要南巡，朱载坖亲自前往嘉靖的永陵，祭祀先帝，向先帝禀报此事。
隆庆三年三月十五日，朱载坖祭祀宗庙之后，将太子朱翊釴叫到了文华殿，向他交代事情。