往往都是依靠个人魅力来指挥这些副将、参将。
即便是现在，武将系统中不鸟总兵的也大有人在，仅仅举个例子，神枢营副将署都督佥事孙国臣为署都指挥佥事，充分守延绥东路右参将。时新定营，制改总督为总兵，诸将以其权轻，多不受约束者。国臣尤骄倨，初入营，直驰总兵中路，与抗礼。
孙国臣一个分守参将，就不把总兵当回事。原因也很简单，总兵虽与部将明显有地位高低之分，但并无权力截然高下之别。比如，副总兵虽处总兵之下，但协守副总兵却并不受总兵节制，而是独立镇守地位较总兵驻地稍逊之地区。不仅如此，即使受到总兵节制之分守副总兵以下武将，亦在军事决策上，具有与总兵共同谋议之权。所以一些性格比较倨傲的武官不服总兵节制也是正常的事情。
而且即便是总兵能够摆平自己麾下的副将、参将们，还要面对各级文官的监督，这种情况，连杨博也曾经说过：今一总兵而不与之赏罚之权，监之以巡抚、巡按、守巡、郎中，一有胜负，则府通判、经历皆得监制之。
这样话，总兵根本无法有效行使指挥权，怎么能够领兵御敌。所以朱载坖认为，要想对抗俺答，首先就要从这两点做起，重将权是现在的当务之急。
边关的督抚大员们还好，尤其是这些御史们，他们往往不通军务，胡乱指挥，一旦战败，又将责任完全推给武将们，这样一来，九边官军能够打胜仗才是怪事了。
所以朱载坖具本嘉靖，认为应该改革目前的九边指挥体系，在现有的情况之下，总督节制巡抚和三司，在军政上有决策、指挥的权力，还有一定的监督、司法权。巡抚亦属文官，地位虽低于总督，同样是执行和监察地方军政大事的特遣官吏。在监察方面，还有都察院系统的巡按御史和六科给事中。
对于地方的控制已经是极其严密了，而总兵又不得专其职守，重其将权，如何能够临敌制胜？所以朱载坖还是认为应当重将权。
朱载坖在奏疏中指出：以将用兵，而以文臣招练。以将临阵，而以文官指发。以武略备边，而日增文官于幕。以边任经一抚，而日问战于朝，此极弊也！自古命将出师，最忌中制，若往复奏请，必致坐失机宜。将权不重
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