朱载坖在处理完和这些西洋人的事情之后，就收到了从安南来的奏报，对于官军轻取谅山、太原，朱载坖并不稀奇，现在正值安南的秋冬季节，气候干燥，官军又以雷霆之势，占据兵力优势，安南人是肯定抵挡不了的，朱载坖命令沐昌祚和刘綎指挥官军追击安南军队，务必要将其全部歼灭。
而更加重要的是在安南建立起朝廷的统治，这次和上次成祖征讨安南是不同的，上次成祖皇帝征讨安南，第一时间确实是没有想要将安南予以郡县的，但是这次朱载坖的目的就是将安南予以郡县，所以朱载坖提前做好了准备，相应的官僚队伍在之前已经组建好了，现在朝廷大军已经占据了安南北方靠近大明的部分州县，相应的统治机构也就应当设立起来了。
朱载坖命令在之前准备的交趾布政使司、按察使司和都指挥使使司的官吏们前往这些已经被官军所占领的地方，恢复大明在交趾布政使司的统治，首先要做的就是恢复生产，安定民心，对于原本交趾的官吏，要加以甄别之后再予以使用，对于那些素有民愤的，非常之时行非常之事，要予以立即处置。
为了迅速安定民心，朱载坖命令没收原来安南官僚、贵族的土地，将之分配给百姓耕作，同时宣布在安南三年免征，进行人口和土地清丈，同时就是对于这些地方的土司，也要予以招抚，先暂时将他们安抚下来，对于安南的百姓，该赈济的也要予以赈济，同时将大明境内的无地百姓迁移到安南来，用以增加朝廷在安南的劳动力。
同时朱载坖命令将这些战俘组织起来，为官军修筑道路，同时将两广、湖南、福建、云南等卫所有家有口的军余子弟组织起来，编成卫所，前往安南屯垦，朱载坖明确指令地方，要将最好的土地拨给卫所官军，同时五年免征，不必上缴军屯籽粒。就是要保证朝廷对于安南的绝对控制，这点是朱载坖很明确的事情，要迅速建立起朝廷在安南的统治秩序，决不能重蹈永乐南征的覆辙，要征之以武，安之以抚，将已经占领的地方迅速安定下来，建立起朝廷在安南的统治秩序。
而在安南，官军也要安南北部试图歼灭郑氏的主力，从谅山、太原败退下来的安南军队，遭到了官军的衔尾追击，沐昌祚、刘綎
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