供给是个大问题，从广西运粮到安南，需要经过涉鸡陵、隘留、丘温、凭祥、龙州、太平等地，这些都是有名的瘴区。运送给养的士卒往往死伤惨重，同时安南人还伏击官军的后勤，导致官军后勤困难，这也是一个重要的问题。
当然，最关键的就是从张辅之后，官军的将领没有张辅这样的能力，用后人评价的话说就是：“蛮疆险远，易动难驯，数年之间叛者数起，柳升以轻敌丧师，王通以畏怯弃地。虽黄福惠爱在交州，叛人心折，而大势已去，再至无功。交阯内属者二十余年，前后用兵数十万，馈饷至百余万，转输之费不与焉，至是弃去。官吏军民还者八万六千余人，其陷于贼及为贼所戮者不可胜计。而土官向义者陶季容、陈汀之属，乃往往自拔来归。”
对于大明来说，在安南的失败确实是严重挫折，使得大明国威沦丧，在南洋藩属中的威信大大的降低，更加重要的是，给了安南一种错觉，就是大明也不过如此，这也是后来安南之所以敢于屡屡挑衅天朝的重要原因。朱载坖不准备惯着安南了，在有生之年，不把这帮猴子的猴脑打出来，他这个皇帝也就别干了。
朱载坖要收拾安南，已经是摆在明面的事情了，朝廷官员是都很清楚的，甚至于安南人自己也很清楚，所以安南人这次选择支持广西的叛军，就是要延缓大明动手的时间，好能够提前有所准备，但是朱载坖迅速调遣官军平叛，同时派出倭人来袭扰安南，离动手的时间已经是越来越近了。
通过前线的战报，朱载坖已经了解到官军在广西进展还是比较顺利的，这次官军按照朱载坖的旨意残酷的镇压了这些叛军，这是朱载坖很少见的行为，一般情况下朱载坖并不会要求官军赶尽杀绝，但是这次情况不同，这些瑶人屡屡所乱，朱载坖已经无法容忍他们，而且和安南勾结，这无疑触犯了朱载坖的忌讳，而且朝廷征讨安南在即，一旦这些瑶人再次作乱的话，无疑会严重的影响朝廷征讨安南的计划，所以朱载坖采取的办法就是严加诛戮，以保证广西的安定。
而戚继光在详细的检讨了之前大明征讨安南的经验和教训，向朱载坖上疏道：“安南小丑，负固不庭，天讨所加，宜有长算。是役也，大率以兵为先，食
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